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- Expasy - ProtParam
ProtParam [Documentation Reference] is a tool which allows the computation of various physical and chemical parameters for a given protein stored in UniProtKB or for a user entered protein sequence
- Expasy - ProtParam documentation
The parameters computed by ProtParam include the molecular weight, theoretical pI, amino acid composition, atomic composition, extinction coefficient, estimated half-life, instability index, aliphatic index and grand average of hydropathicity (GRAVY)
- ProtParam References - Expasy
Protein Identification and Analysis Tools on the Expasy Server; (In) John M Walker (ed): The Proteomics Protocols Handbook, Humana Press (2005) pp 571-607
- Expasy - Translate tool
Translate is a tool which allows the translation of a nucleotide (DNA RNA) sequence to a protein sequence
- Expasy - ProtScale
ProtScale allows you to compute and represent the profile produced by any amino acid scale on a selected protein An amino acid scale is defined by a numerical value assigned to each type of amino acid The most frequently used scales are the hydrophobicity or hydrophilicity scales and the secondary structure conformational parameters scales, but many other scales exist which are based on
- Expasy - ProtParam
protparam user-provided sequence: 10 20 30 40 50 60 mkvvpeknav rilwgrerga ramgaqrllq elvedktrwm kwegkrvelp dsprstflla 70 80 90 100 110 120 fspdrtllas thvnhniyit evktgkcvhs lighrrtpwc vtfhptisgl iasgcldgev
- Expasy - SIB Swiss Institute of Bioinformatics
Over 160 high-quality database and software tools are provided by SIB Groups to the global life science community They are hosted on Expasy, SIB’s bioinformatics resource portal
- Expasy - Compute pI Mw tool
Compute pI Mw for UniProtKB entries or one user-entered sequence Please enter one or several UniProtKB AC ID (e g P04406 or ALBU_HUMAN), each on a separate line Alternatively, enter one protein sequence in single letter code
- Contact us - Expasy
Contact the Expasy team for any inquiries or support regarding their bioinformatics tools and resources
- Protein Analysis Tools on the ExPASy Server 571 52
is available through the ExPASy World Wide Web server (2) Analysis tools include Compute pI Mw, a tool for predicting protein isoelectric point (pI) and molecular weight (Mw); ProtParam, to calculate various physicochemical
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